91學年度自然考科為配合新的課程架構，關於試卷設計及題型有如下的說明：
一、自然考科的試卷分為兩部分，第一部分試題以高一必修課程為主要範圍，包括高一的基礎物理、基礎化學、基礎生物、基礎地球科學。
二、第二部分試題則偏重高二課程，包括高二的物質科學（物理篇）、物質科學（化學篇）、物質科學（地球科學篇）、生命科學等四科。
三、為配合課程的設計，第一部分試題考生須全部作答；第二部分試題可以全答，但只要答對一定題數，該部分即為滿分。至於兩部分的佔分比例，大約參考課程標準的節數比。
四、為考量100分鐘的作答時間，總題數以不超過68題為原則。考量高一及高二的上課節數，若總題數68題為例，則第一部分約48題（每科約12題），第二部分約20題（每科約5題），答對16題，則第二部分即得滿分。
五、第一部分沿用以往之題型，主要是配合測驗目標作設計，以評量學科的基本知識及推理思考的能力為主。第二部分在上例所述之20題中有16題採科學推理題型，有4題則偏重各科學科知識。
六、科學推理的題型可分成三大類，分別為資料解讀、結果整理及觀點辨證（詳見參考試卷）。
七、為考量有些學生在高二自然科四科之中，只選其中一科修習，第二部分之科學推理題型儘量不以學科知識為答題之依據，考生只要認真修習高二「四選一」課程中之任一科，應可回答大部分的問題。
自然考科的測驗目標，著重於評量考生對自然科學整體應有的基本知識與技能。自然科學包括甚廣，在此我們將重點放在物理、化學、生物、地科這四科。
參加自然考科測試的考生，有些是選讀人文、社會學科的，有人或許質疑此測驗目標是否適合這些學生，其實在人文、社會學科的知識範疇中，相當講究合理的推理能力及對人類文明的前瞻性，因此只要自然考科的測驗目標及試題運用得當，對學生應有正面的助益。
自然考科的測驗目標分為四大部分，第一部分基本的科學知識和概念，應是大部分考生所該具備，其次利用科學資料和圖表的能力，其認知層次又比前述更高，而推理能力及對科學應用的了解，是指對科學方面的學習全盤融會貫通後，進而能舉一反三，並對自然科學的本質與實用性，有正確的體認。
一、測驗考生基本的科學知識和概念
˙知道重要的科學名詞和定義
˙了解基本的科學現象、規則、學說、定律
˙知道如何由簡單實驗觀察自然現象
二、測驗考生應用科學資料和圖表的能力
˙能看出數據、式子或圖形的意義
˙能選用適當的資料
˙能由數據找出規則或關係
˙能由圖表看出明顯特性
˙根據圖表作結論
三、測驗考生的推理能力
˙能找出問題的因果關係
˙根據圖表說明重要科學原理
˙能根據科學定律、模型，解釋日常生活現象
˙根據事實作合理的推斷
四、測驗考生對科學應用的了解
˙了解科學之侷限性
˙了解科學對人類文明的影響
在大學入學考試中心自然考科參考試卷中，大致有幾個主要方向：
一、所考的概念全為課本主要概念，絕少有冷僻或刁難的試題。這些概念常常是延伸自國中教材的，也是自然學科中一再強調的基礎概念。
二、著重相關概念之融會統整，尤其是跨越不同學科的綜合題，一道題目中可能同時會運用到生物、化學、物理、地球科學的相關概念。
三、強調生活化，考試題材常取自日常生活之中。
四、提供適當的情境使題目活潑化，也提供答題所需的資料和圖表。儘可能降低記憶背誦型試題之比例。
五、不特別強調試題的難度，以評量學科的基本知識與能力為主。
91學年度學科能力測驗自然考科的考試範圍，是以教育部修正發佈的八十四年版高級中學課程標準為主，所涵蓋的課程範圍以高一、高二課程為主。
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科目 |
高一 |
高二 |
備註 |
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基礎科學 |
基礎物理(2)＊
基礎化學(2)＊
基礎生物(2)＊
基礎地科(2)＊ |
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必修 |
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物理 |
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物質科學(物理篇)(3,3)＃ |
高二為「四選一」 |
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化學 |
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物質科學(化學篇)(3,3)＃ |
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生物 |
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生命科學(2,2)≠ |
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地科 |
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物質科學(地科篇)(2,2)≠ |
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註：(2)＊表示一學期兩節課
(3,3)＃表示上、下學期各三節課
(2,2)≠表示上、下學期各兩節課 |
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為配合新的課程設計，自然考科的命題將有如下的調整（其他請參見前言部分）：
一、91學年度學科能力測驗自然考科的試卷分為兩部分，第一部分試題以高一必修課程為主要範圍，包括高一的基礎物理、基礎化學、基礎生物、基礎地球科學。
二、第二部分試題則偏重高二課程，包括高二的物質科學(物理篇)、物質科學(化學篇)、物質科學(地球科學篇)、生命科學等四科。
準備建議
如何準備自然考科，大致可以朝以下幾個方向進行：
一、將高中基礎自然學科課本重新瀏覽一遍
一方面建立全盤的印象，一方面挑出課本最主要和最基本的概念，還可以回頭請教高一時的老師，相信找出這些主要概念不致有太大困難。尤其是高一時一再重覆提及的概念，就可能是最重要的概念。
二、對所選出的主要概念加以複習
複習的重點不在於背誦內容或記憶公式，而是將概念一一加以釐清，並知道簡單的應用。例如物理中的牛頓運動定律，不用去作許多計算，因為在這種考試中出現計算題的機會不多。重點應放在概念層次的理解上，概念形成的前因後果及適用範圍和條件要理解清楚。
三、某些主要概念常在課程設計上有實驗配合，不要忽略這些實驗的過程及其結果和條件的限制。
由於未來的考試相當重視科學過程技能和概念的整合，所以未來呈現實驗結果的圖表資料常常會和概念一起考，再者了解實驗有助於相關概念的理解。
四、不要太依賴參考書
目前坊間參考書大多是針對現行聯考制度而設計的，本中心投入相當多的人力，致力於新題目和題型的開發與設計，這些題目的型態與精神還有許多變化，所以不要太依賴參考書，還是將重點放在課本為是。
五、留心日常生活中的相關問題，甚至最近報章雜誌所討論的問題
基本的立論點在於自然學科可以協助我們理解日常生活中所面臨的問題和現象，是每一個國民必須具備的基本素養。因此考題的設計不會太強調學科理論，而會著重生活化的題材，自然科學概念中那些是和生活互相契合的，或是最近社會上面臨的問題都是出題的好素材。
六、圖表資料的閱讀能力是參考試卷中命題的重點
1.曲線變化的情形，如正、反比，極大、極小值等（例物理中速度、加速度的變化曲線，化學中反應速率的曲線等）
2.兩條曲線變化的比較（例如生物中出生率、死亡率及人口成長率比較）
3.等值線的閱讀（例地球科學之等壓線、等溫圖）
在閱讀圖表時首先要注意座標，不先看清座標，單單注意曲線的變化是無法看出任何意義的。此外，各科中有許多示意圖也是應該注意的重點，這些示意圖常常比文字說明要容易理解的多，務必要配合複習。
